Çanakkale süper amatör ligte 2019-2020 sezonu 13 takımla oynanacak. 2018-2019 sezonunu şampiyon olarak tamamlayan Bozcaadaspor’un Bölgesel Amatör lig baraj karşılaşmasında ÇanakakleDardanelspor’u mağlup edip Bölgesel Amatör lige yükselmesinin ardından Çanakkale Dardanelspor tarihinde ilk defa süper amatör lige düşen takım olurken, yine 2018-2019 sezonunda Çardakspor ve Yenicespor kulüpleri birinci amatör lige düşen takımlar oldular. 1.Amatör ligte şampiyon olan Gümüşçayspor ve play-off grubu birincisi olan Hastanebaayırıspor kulüpleri ise yeni sezonda süper amatör ligte mücadele edecekler. Bölgesel amatör ligten düşen Adaspor ise bu sezon süper amatör ligte yer alacak.
Yeni Sezonda Süper Amatör ligte yer alacak kulüpler ise şöyle oldu;
Çanakkale Dardanelspor, Adaspor, Geliboluspor, Yeni Çanspor, Ezinespor, Karabiga Belediyesi Gençlik ve Spor, Çanakkalespor, Lapsekispor, Gökçeadaspor, Küçükkuyu Gençlerbirliği, Kepezspor, Gümüşçayspor, Hastanebaayırıspor